第一个渊源

源于姬姓，出自西周时期翦蠹氏，属于以官职称谓为氏。

翦蠹氏，亦称翦虫氏、翦氏，为西周时期所设置的官职，隶属秋官所辖，专职负责翦除农业、林业、家居害虫，属辖设置下士一名，史一名，徒两名。由于其属于经验型官职，因此多为世袭。

南北朝时期的北周政权仿周制，亦设置有翦蠹中士(翦虫中士)之职，属正二命官阶(正八品)，下设翦蠹下士(翦虫中士)等附属官员，隶属于秋官府。

在翦蠹氏、翦虫氏的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称蠹氏、翦氏、虫氏。

第二个渊源

源于姬姓，出自春秋时期吴国公族，属于以官职称谓为氏。

春秋时期，吴国公族中有专职负责治安的小官，称蠹鱼史，负责治理乞丐一类氓民。

在典籍《周礼·翦氏》中记载：“穿食人器物者，蠹鱼亦是也”，指的是农业、林业、家居害虫。

春秋时期，诸侯纷争，战乱频乃，因此而流离失所的贫民百姓以沿乞为生者甚多，世人将诸多乞衣食者称作“乞丐”，而将职业化的乞丐称作“蠹鱼”，后衍申为蠹民(害人的人或事物)、蠹政(害民的政令)、蠹言(害人的言辞)、蠹役(腐败的吏役)、五蠹(危害社会的五种人，即滥儒、游侠、政客、逃兵、奸商)等。

蠹鱼史，就是专门负责清理城内乞丐的治安小官，“酉逐郭外”是其主要职责，就是在下午5:00之后将城中乞丐赶出城外，以防夜盗和奸细等治安事件。

在蠹鱼史的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称蠹鱼氏，后省文简化为单姓蠹氏、鱼氏。

在后来的郑国中，亦设有同职称的官吏，亦称蠹鱼氏，不过是专职设以提防敌对国家的奸细，后也省文简化为单姓蠹氏、鱼氏等。

由蠹鱼氏演化的鱼氏，与江汉地区的鱼伯井姬的古鱼国之鱼氏非同源，但同宗。