A、位于同源染色体上同一位点，控制相对性状的两个基因称为等位基因，A错误； 　　B、基因型为AaBbCcDdEe的细胞含2个染色体组，B错误； 　　C、一个不含32P标记的双链DNA分子，在含有32P标记的脱氧核苷酸原料中经过n次复制后，根据DNA分子半保留复制特点，形成的DNA分子中含32P的DNA分子数为100%，C错误； 　　D、一个基因型为AaXbY的果蝇，产生了一个AaaXb的精子，说明减数第一次分裂后期，含有基因A和基因a的同源染色体未分离，形成两个次级精母细胞的基因型为AAaaXbXb、YY，减数第二次分裂后期含有a的姐妹染色单体分开后移向了同一极，因此其产生AaaXb精子的同时产生的另三个精子的基因型为AXb、Y、Y，D正确． 　　故选：D．