基因组时代指的是基因工程在实践中的应用过程.有基因来推测合成的蛋白质在生物体内所起的作用.而后基因组时代则是指蛋白质工程.由一种特定的蛋白质的功能入手分析什么的氨基酸序列能使合成的蛋白质具有这种功能,进而推测mRNA的核苷酸序列,再由mRNA的核苷酸序列来推测DNA的一条链的碱基序列.即中心法则的逆过程.基因组时代研究的是基因,这种基因是生物界具有的,而后基因组时代研究的蛋白质不一定是生物界具有的,可以是改造过的蛋白质.这两种手段都是对生物的人为操作,以利于为人类带来一定的效益.