问题标题:
【我想问问我加的酶切位点和保护碱基对不对AIF-ECOR1:cggaattcgctacaagcacgctctaacatctAIF-BAMH1:cggatcccggactctgtctcactctctgat保护碱基和酶切位点我用空格分开了,好辨认!扩出来后准备双酶切后连接质】
问题描述:
我想问问我加的酶切位点和保护碱基对不对
AIF-ECOR1:cggaattcgctacaagcacgctctaacatct
AIF-BAMH1:cggatcccggactctgtctcactctctgat
保护碱基和酶切位点我用空格分开了,好辨认!
扩出来后准备双酶切后连接质粒PCDNA3.1
但是今天试了退火温度60.55都不行
苏汉华回答:
EcoRI的识别序列和切割序列都没有问题,保护碱基也行.但是BamHI的保护碱基太少,这样PCR产物的2小时酶切效率只有10%,20小时酶切效率只有25%,最好能够设计“CG”为保护碱基,这样能够保证2小时及20小时酶切效率在90%以上.另外我建议你把退火温度设置在50.2摄氏度至51.9摄氏度这个范围内,当然也可以采用Touchdown方法.
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