A、并不是所有的细菌都有荚膜，只是一些细菌的特殊结构．A错误； 　　B、芽孢是细菌度过不良环境的结构，不是所有的细菌都具有．B错误； 　　C、细胞壁是细菌的基本结构，所有的细菌都有．C正确； 　　D、并不是所有的细菌都有鞭毛，只是一些细菌的特殊结构．D错误 　　故选：C．