楼主说的好像是qPCR机器能够读取的荧光频段啊.我本人只做过单色荧光的qPCR,对于多个目标同时反应的qPCR只听说过. 　　因为多个引物对,探针,同时在一锅粥里面,其交互作用及争夺酶和核苷酸等扩增资源,以及荧光跨频段干扰的情况非常复杂难以预测.使用多通道的好处是快速产生大量数据,但是优化的过程很费时,一般只有在样本数量非常大（成百上千的样本）,或者单个样本量非常少（几十ng的RNA）的情况下面使用. 　　通道数目就是你同时能够检测几种不同的目标序列扩增反应.请根据需要和能力选择.通道太多只影响仪器价格,不影响在单通道或较少通道情况下的使用.即是杀鸡用牛刀也.