纤毛和鞭毛由3个主要部分组成：中央轴纤丝、围绕它的质膜和一些细胞质.轴纤丝从纤毛或鞭毛底部的基粒直达顶端,为一束直径约220～240埃的微管,在基粒底部,则集聚成圆锥形束,深入到细胞质中.轴纤丝横切面的微管排列是9＋2式,即中心有一对由中央鞘包裹着的微管,外围环绕以两两连接在一起的9组微管二联体.基体的结构象中心粒一样是9＋0型,但它的9组微管是三联体.纤毛或鞭毛二联体中的微管,就是从基粒三联体中两根微管延伸出来的.