化石是保存在岩层中的生物的遗体、遗物和生活遗迹．直接说明了古生物的结构或生活习性．因此生物进化的直接证据是化石证据．而比较解剖学上的同源器官只是证明了具有同源器官的生物具有共同的原始祖先；胚胎学上的证据（如鳃裂）只是说明了古代脊椎动物的原始祖先都生活在水中．这些证据（包括分类学、遗传学上的证据）的证明面都比较窄．所以为研究地球生物的进化规律，方法多种多样，如比较解剖学，分子生物学，胚胎学等，但是最直接的证据是生物化石，包括遗体化石和遗迹化石．遗体化石是指生物的遗体形成的化石，遗迹化石是指生物的遗物或生活痕迹形成的化石． 　　故答案为：生物化石；遗体化石；遗迹化石．