达尔文把在生存斗争中，适者生存、不适者被淘汰的过程叫做自然选择．遗传变异是生物进化的基础，首先病菌的抗药性存在着变异．有的抗药性强，有的抗药性弱．使用抗生素时，把抗药性弱的病菌杀死，这叫不适者被淘汰；抗药性强的病菌活下来，这叫适者生存．活下来的抗药性强的病菌，繁殖的后代有的抗药性强，有的抗药性弱，在使用抗生素时，又把抗药性弱的病菌杀死，抗药性强的病菌活下来．这样经过抗生素的长期选择，使得有的病菌已不再受抗生素的影响了，可见，病菌抗药性不断增强的原因是抗生素对病菌进行选择的结果．即病菌原来就有抗药性强的个体，在使用抗生素的过程中淘汰了抗药性弱的个体． 　　故选C、D