如图为蛋白质工程操作的基本思路，请据图回答下列问题：

（1）目前蛋白质工程中难度最大的是图中编号___所示过程，其原因是___．

（2）实现③过程的依据有___，由③得到的基因编码区的脱氧核苷酸序列有___（答“一种”或“多种”），这是因为___．这属于哪种获取目的基因的方法：___．

（3）若相关蛋白质的核酸片段是从细胞质中获取的，则④过程表示___．经过④过程得到目的基因，所采取的手段与基因突变相比最大的特点是___．