A、质子数相同的粒子不一定是同种元素，例如水分子和甲烷分子的1个分子中都是含有10个质子，但是不属于同种元素，该选项说法不正确； 　　B、由同种元素组成的物质不一定是单质，例如氧元素组成的氧气和臭氧的混合物不属于单质，该选项说法不正确； 　　C、混合物不一定是由不同种分子构成，例如铁和铜组成的混合物中不含有分子，该选项说法不正确； 　　D、纯净物一定是由同种分子构成的，该选项说法正确． 　　故选：D．