问题标题:
二代测序BS甲基化测序转化率问题BS测序甲基化转化率怎么算出来的为什么要用叶绿体基因组比较Weusedtheunmethylatedchloroplastgenome[21]tocalculatethesumofnon-conversionrateandT-Csequencingerrorrate,w
问题描述:
二代测序BS甲基化测序转化率问题
BS测序甲基化转化率怎么算出来的
为什么要用叶绿体基因组比较
Weusedtheunmethylatedchloroplastgenome[21]to
calculatethesumofnon-conversionrateandT-Csequencingerrorrate,whichisaslowas0.47%to1.17%
急等
潘巨龙回答:
所谓转化率是基于一种没有甲基化的小基因组做比较来算出的,一般用的噬菌体DNA.
转化的时候,非甲基化的C位点转化成(原来是U,PCR变成T)T,但是有些时候由于BS处理的实验条件不同,可能有一些位点没有转化.我们通过一个没有甲基化的基因组做比对,就可以得到大概的转化率了.
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