对于最初始的生命起源,目前尚未明了.而且生物学的进化研究,通常不包括这段初始过程.因为这段过程牵涉到太阳系与地球的形成过程,所以对于生命起源的研究,许多是来自物理学与化学.例如1952年的米勒-尤列实验中,米勒（StanleyMiller）与尤列（HaroldUrey）以氨、甲烷、氢气、氰酸与水等分子,模拟地球的原始状态,并首次在实验室中制造出生物的最基本物质[61].而近年的研究发现,作为氨基酸原料的有机分子,有可能是来自太空中[62],或是海底火山[61]. 　　而关于包括遗传物质在内的有机分子进化过程,现在科学家一般认为核糖核酸比蛋白质与脱氧核糖核酸更早出现,之后出现类似反转录酶的蛋白质,最后才有脱氧核糖核酸,不过这些理论的证据并不多[63].脂肪酸的出现则构成了原始的细胞膜,之后经由内共生等过程,形成最早的单细胞生物