问题标题:
请问用targetscan预测miRNA靶基因,预测结果中sps值和Ta值两项代表什么,是越高越好还是越低越好?
问题描述:
请问用targetscan预测miRNA靶基因,预测结果中sps值和Ta值两项代表什么,是越高越好还是越低越好?
李焰回答:
TA(targetsiteabundance)contribution
SPS(seed-pairingstability)contribution
这篇文献对这两个指标做了很详尽的说明
其中图4d,很形象的把这两个指标作图来比较不同数值的miRNA的效率.
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