卡勒德·胡赛尼认为《群山回唱》的主要主题是失去、痛苦、记忆、爱和亲情。阿卜杜拉和帕丽的骨肉分离是“全书的核心”。故事中的两人后来都成为了“时间流逝的受害者”：哥哥阿卜杜拉一直怀念帕丽，人生的大部分时光都为她痛苦不已；而妹妹帕丽在离开哥哥之后则将他淡忘。然而在故事的最后，帕丽了解了自己的身世，记起阿卜杜拉并在美国与他重逢时，阿卜杜拉却患上了阿兹海默症，已经忘记了妹妹。胡赛尼表示，“这个问题已经被提过很多次：‘回忆’究竟是一种福气，保护着你珍爱的一切；还是一种诅咒，让你不断重现生命中最痛苦的时刻，经历过的艰辛、挣扎和悲痛。”这一系列事件的组合使得《群山回唱》“有点像一个彻底颠复的童话故事”，“开头是痛苦的分离，而结尾则是感人的重逢”，然而整个故事和最终的重逢“并不完全符合读者的期望”。但胡赛尼认为这“正像人生一样”。他同时还认为自己的这部作品和前两部作品《追风筝的人》、《灿烂千阳》一样，都是与“爱”相关的故事，但并非传统意义上一男一女之间的浪漫爱情，更多的是人们意想不到的角色之间萌发的爱和感情，在出乎意料的环境下产生的热烈情感。

　　国际特赦组织美国分会官员、专栏作家拉菲娅·扎卡利亚（Rafia Zakaria）在书评中写道，助人者和受助者之间的相互依赖以及相伴相生的愧疚和感恩也是这部小说的明显主题。例如帕尔瓦娜和孪生姐姐马苏玛这对“普通的姐妹之间辛酸的故事”中，帕尔瓦娜“把美丽的姐姐推下树枝这一复仇之举，造成了一生的道德负担”。二人都从此带上了枷锁：姐姐失去了自理生活的能力，而妹妹也在照顾姐姐饮食起居的同时，深深明白自己正是造成这一切不幸的根源，内心因此濒临崩溃。扎卡利亚还认为，“依赖”的主题在纳比的故事中也得以延续，他促成了瓦赫达提夫妇领养帕丽，又独自一人悉心照顾自己中风瘫痪的老板。胡赛尼以细致的描写，表现了纳比照料瓦赫达提先生时的贴心，也深入探讨了助人者和受助者之间的道德难题。