醇工业最大的问题是其高成本。美国乙醇工业正在政府的支持下通过改良技术来降低成本。美国能源部（DOE）和农业部（USDA）已经拨出充足的资金用于多方面的工作，其总的目的是以各种木质纤维素原料来生产乙醇以及多种联产品。USDA农业研究局的预算为近1600万美元，DOE计划投入更多。