保存科学配伍合理微生态制剂属于活菌制剂，若保存方法不好、保存条件不当，都会造成益生菌活菌数减少活菌失活，必须根据要求进行保存，一般应保存在干燥、凉暗的地方，适宜的保存温度在15℃以下为好，但不宜长时间存放。已经开启但未用完的微生态制剂，应在保持干燥、凉暗的同时，加强密封管理，因为氧气可使其中的厌氧菌失活。使用微生态制剂时，一般不要与抗生素及其它抑菌、杀菌药物混和使用，如果病情确实需要使用这些药物，也应间隔24小时以上先后使用。一般是先用抗菌性药物清理肠道，消除病原菌为益生菌的定植和繁殖清除障碍，然后再服用微生态制剂，这样就可以达到较好的使用效果。